Les usines d’embouteillage ou de conditionnement sont le dernier maillon de la chaîne de production. En plus de conditionner l’huile dans des conteneurs de type et de taille appropriés (capacité < 5 L pour la consommation des ménages et 25 L pour les conserveries, les hôtels et les entreprises de restauration et les institutions), elles mélangent également les huiles vierges avec des huiles d’olive raffinées ou des huiles de grignons d’olive pour obtenir un produit ayant des caractéristiques spécifiques. L’Espagne compte 1 519 usines de conditionnement, dont 90 % sont associées à une huilerie.